Hey amafinode,
Es geht hier um einen fatalen Softwarefehler der zu Fehlbuchungen geführt hat und nicht um spezielle Steuerliche fragen. Der Anwender hat hier ja nichts falsches ausgewählt, beim erstellen von Rechnungen und beim verbuchen des Zahlungseingangs.
Das die Software im Hintergrund quatsch macht, sieht man erst bei der Prüfung der einzelnen Konten.
Einem Softwarebug kann auch ein Steuerberater aufliegen. Daher finde ich deine Reaktion, den Softwarefehler auf den Kunden zu schieben, fehl am Platz.