Sind diese auch in der Datenbank abgelegt?
Ja.
Ich frage mich, wie Buhl die mit einem neuerlichen Programmupdate wieder restoren will
Wenn die denn wirklich gelöscht sind und nicht bloß nicht angezeigt werden. Die Systemregeln wiederherstellen dürfte wohl kein Problem sein, aber die manuell erstellten kann man natürlich nicht wiederherstellen, wenn sie wirklich weg sind.
Aber wie bereits mehrfach ausgeführt solltest Du schon mal das Backup suchen und sicherstellen, welches beim ungewollten Upgrade automatisch angelegt wird.